Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG12O94817 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG12O94817 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG12O94817 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG12O94817 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG12O94817 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG12O94817 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG12O94817 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG12O94817 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG12O94817 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG12O94817 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG12O94817 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG12O94817 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG12O94817 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG12O94817 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG12O94817 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG12O94817 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG12O94817 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG12O94817 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG12O94817 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG12O94817 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG12O94817 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG12O94817 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG12O94817 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG12O94817 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG12O94817 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG12O94817 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG12O94817 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG12O94817 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG12O94817 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG12O94817 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG12O94817 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG12O94817 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG12O94817 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG12O94817 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG12O94817 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG12O94817 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG12O94817 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG12O94817 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG12O94817 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG12O94817 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG12O94817 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG12O94817 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG12O94817 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG12O94817 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG12O94817 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG12O94817 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG12O94817 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG12O94817 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG12O94817 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG12O94817 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG12O94817 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG12O94817 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG12O94817 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG12O94817 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG12O94817 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG12O94817 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG12O94817 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG12O94817 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG12O94817 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG12O94817 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG12O94817 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG12O94817 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG12O94817 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG12O94817 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG12O94817 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG12O94817 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG12O94817 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG12O94817 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG12O94817 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG12O94817 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG12O94817 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG12O94817 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG12O94817 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG12O94817 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG12O94817 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG12O94817 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG12O94817 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG12O94817 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG12O94817 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG12O94817 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG12O94817 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG12O94817 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG12O94817 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG12O94817 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG12O94817 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG12O94817 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG12O94817 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG12O94817 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG12O94817 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG12O94817 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG12O94817 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG12O94817 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG12O94817 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG12O94817 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG12O94817 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG12O94817 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG12O94817 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG12O94817 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG12O94817 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms