Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms