Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAK2O60296 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms