Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms