Protein–RNA interactions for Protein: O00217

NDUFS8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS8O00217 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NDUFS8O00217 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NDUFS8O00217 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NDUFS8O00217 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS8O00217 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS8O00217 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS8O00217 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS8O00217 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS8O00217 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS8O00217 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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NDUFS8O00217 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS8O00217 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS8O00217 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS8O00217 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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NDUFS8O00217 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS8O00217 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS8O00217 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS8O00217 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS8O00217 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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NDUFS8O00217 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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NDUFS8O00217 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFS8O00217 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFS8O00217 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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NDUFS8O00217 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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NDUFS8O00217 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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NDUFS8O00217 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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NDUFS8O00217 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS8O00217 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS8O00217 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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NDUFS8O00217 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS8O00217 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS8O00217 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS8O00217 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS8O00217 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS8O00217 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS8O00217 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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NDUFS8O00217 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS8O00217 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS8O00217 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS8O00217 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS8O00217 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS8O00217 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS8O00217 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS8O00217 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS8O00217 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS8O00217 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS8O00217 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS8O00217 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS8O00217 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS8O00217 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS8O00217 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS8O00217 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS8O00217 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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