Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms