Protein–RNA interactions for Protein: A6NMT0

DBX1, Homeobox protein DBX1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBX1A6NMT0 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DBX1A6NMT0 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DBX1A6NMT0 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DBX1A6NMT0 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DBX1A6NMT0 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DBX1A6NMT0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DBX1A6NMT0 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DBX1A6NMT0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DBX1A6NMT0 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DBX1A6NMT0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DBX1A6NMT0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms