Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms