Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms