Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms