Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 GAPVD1-201ENST00000265956 2667 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 TP63-201ENST00000264731 4909 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNAH9-203ENST00000454412 13452 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGSF11-201ENST00000354673 3206 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 NCAM2-202ENST00000400546 8135 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHIC1-201ENST00000373502 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 LYRM7-201ENST00000379380 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRHDE-201ENST00000261180 10733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 LMO7-218ENST00000526202 4121 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 F13A1-201ENST00000264870 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEMA6A-210ENST00000510263 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHD7-203ENST00000525508 4777 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 COL12A1-207ENST00000483888 9637 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNAH11-201ENST00000328843 13917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIF23-203ENST00000395392 3357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP2C1-208ENST00000504948 4714 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL7L1-201ENST00000304734 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 NOX1-202ENST00000372960 2418 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 PIEZO2-210ENST00000580640 8334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGSF1-206ENST00000370910 4406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 MELK-206ENST00000536329 2283 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00536-201ENST00000505156 2692 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 NYAP2-202ENST00000636099 5461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNX25-202ENST00000504273 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 BEST3-212ENST00000553096 2929 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLSPN-201ENST00000251195 4769 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 RC3H1-203ENST00000367696 11261 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF43-201ENST00000354959 2881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF300-204ENST00000427179 4155 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 NHSL2-207ENST00000633930 13660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZMAT1-206ENST00000540921 3139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 F5-202ENST00000367797 7024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 USP3-201ENST00000268049 5311 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPTBN1-201ENST00000333896 9075 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 MKI67-202ENST00000368654 12678 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRIM6-201ENST00000278302 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC24A1-212ENST00000546330 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMCC3-203ENST00000551457 4361 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF101-208ENST00000592502 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SKP271-201ENST00000410528 320 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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KRTAP9-3Q9BYQ3 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF841-203ENST00000594295 3819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 TAOK1-202ENST00000536202 4068 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL080317.3-201ENST00000607434 4315 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 TATDN2P3-201ENST00000452855 3665 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDGFC-203ENST00000502773 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR11G2-203ENST00000641879 4415 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADGRE3-201ENST00000253673 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF268-209ENST00000541009 3773 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDR44-201ENST00000254029 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 BACH2-201ENST00000257749 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 FCRL5-201ENST00000361835 5390 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
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