Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SHANK2Q9UPX8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms