Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FZD1Q9UP38 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms