Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms