Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI54

PRO0628, Putative uncharacterized protein PRO0628, humanhuman

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRO0628Q9UI54 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRO0628Q9UI54 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PRO0628Q9UI54 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
PRO0628Q9UI54 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PRO0628Q9UI54 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PRO0628Q9UI54 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PRO0628Q9UI54 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PRO0628Q9UI54 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PRO0628Q9UI54 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PRO0628Q9UI54 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
PRO0628Q9UI54 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PRO0628Q9UI54 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PRO0628Q9UI54 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PRO0628Q9UI54 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PRO0628Q9UI54 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PRO0628Q9UI54 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PRO0628Q9UI54 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms