Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms