Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HDAC6Q9UBN7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms