Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC88CQ9P219 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms