Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms