Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms