Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD0

FBXO8, F-box only protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO8Q9NRD0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXO8Q9NRD0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms