Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CBX8Q9HC52 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms