Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms