Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2E6

SEMA6A, Semaphorin-6A, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6AQ9H2E6 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEMA6AQ9H2E6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms