Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms