Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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