Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ4

TRIM34, Tripartite motif-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM34Q9BYJ4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM34Q9BYJ4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms