Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181 ms