Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DUSP9Q99956 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms