Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms