Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED4Q96RK1 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms