Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms