Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms