Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms