Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms