Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms