Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms