Protein–RNA interactions for Protein: Q93074

MED12, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED12Q93074 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED12Q93074 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED12Q93074 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED12Q93074 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED12Q93074 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MED12Q93074 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MED12Q93074 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MED12Q93074 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MED12Q93074 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MED12Q93074 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MED12Q93074 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MED12Q93074 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MED12Q93074 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MED12Q93074 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MED12Q93074 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MED12Q93074 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MED12Q93074 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MED12Q93074 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MED12Q93074 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MED12Q93074 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MED12Q93074 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MED12Q93074 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MED12Q93074 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MED12Q93074 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MED12Q93074 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MED12Q93074 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MED12Q93074 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MED12Q93074 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MED12Q93074 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MED12Q93074 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MED12Q93074 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MED12Q93074 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MED12Q93074 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MED12Q93074 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MED12Q93074 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MED12Q93074 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MED12Q93074 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED12Q93074 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED12Q93074 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED12Q93074 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED12Q93074 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED12Q93074 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED12Q93074 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MED12Q93074 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MED12Q93074 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MED12Q93074 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED12Q93074 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED12Q93074 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED12Q93074 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED12Q93074 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED12Q93074 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED12Q93074 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED12Q93074 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED12Q93074 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED12Q93074 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED12Q93074 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED12Q93074 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED12Q93074 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED12Q93074 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MED12Q93074 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED12Q93074 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MED12Q93074 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED12Q93074 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED12Q93074 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED12Q93074 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED12Q93074 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED12Q93074 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MED12Q93074 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MED12Q93074 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED12Q93074 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED12Q93074 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED12Q93074 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED12Q93074 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED12Q93074 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED12Q93074 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MED12Q93074 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED12Q93074 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MED12Q93074 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED12Q93074 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED12Q93074 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MED12Q93074 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED12Q93074 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED12Q93074 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED12Q93074 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED12Q93074 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED12Q93074 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED12Q93074 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED12Q93074 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED12Q93074 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED12Q93074 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED12Q93074 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MED12Q93074 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MED12Q93074 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MED12Q93074 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MED12Q93074 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MED12Q93074 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MED12Q93074 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MED12Q93074 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MED12Q93074 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MED12Q93074 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms