Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWX9

SELENOM, Selenoprotein M, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOMQ8WWX9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SELENOMQ8WWX9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SELENOMQ8WWX9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SELENOMQ8WWX9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SELENOMQ8WWX9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SELENOMQ8WWX9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SELENOMQ8WWX9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SELENOMQ8WWX9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SELENOMQ8WWX9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SELENOMQ8WWX9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SELENOMQ8WWX9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SELENOMQ8WWX9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SELENOMQ8WWX9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms