Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8G6

C15orf54, Putative uncharacterized protein C15orf54, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf54Q8N8G6 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C15orf54Q8N8G6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms