Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCSAMQ8N6F7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms