Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms