Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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