Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms