Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
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