Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms