Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HRCT1Q6UXD1 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HRCT1Q6UXD1 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
HRCT1Q6UXD1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HRCT1Q6UXD1 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HRCT1Q6UXD1 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HRCT1Q6UXD1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HRCT1Q6UXD1 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HRCT1Q6UXD1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HRCT1Q6UXD1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HRCT1Q6UXD1 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HRCT1Q6UXD1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HRCT1Q6UXD1 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HRCT1Q6UXD1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HRCT1Q6UXD1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HRCT1Q6UXD1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HRCT1Q6UXD1 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HRCT1Q6UXD1 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HRCT1Q6UXD1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HRCT1Q6UXD1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HRCT1Q6UXD1 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HRCT1Q6UXD1 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HRCT1Q6UXD1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HRCT1Q6UXD1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HRCT1Q6UXD1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HRCT1Q6UXD1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HRCT1Q6UXD1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HRCT1Q6UXD1 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HRCT1Q6UXD1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HRCT1Q6UXD1 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HRCT1Q6UXD1 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HRCT1Q6UXD1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HRCT1Q6UXD1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HRCT1Q6UXD1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HRCT1Q6UXD1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HRCT1Q6UXD1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HRCT1Q6UXD1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
HRCT1Q6UXD1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HRCT1Q6UXD1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HRCT1Q6UXD1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HRCT1Q6UXD1 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HRCT1Q6UXD1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms