Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms