Protein–RNA interactions for Protein: Q68G75

LEMD1, LEM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD1Q68G75 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LEMD1Q68G75 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LEMD1Q68G75 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LEMD1Q68G75 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LEMD1Q68G75 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LEMD1Q68G75 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LEMD1Q68G75 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms