Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms